海州区因为滨临黄海而得名。春秋战国时期，先属鲁后楚，属郯国。秦朝属东海郡。西汉属徐州刺史部东海郡。东汉隶属于徐州刺史部东海郡。三国魏时属东海国。西晋隶属于徐州东海郡。南朝宋明帝泰豫元年(西元472)于郁洲岛立青州、冀州。齐高帝建元元年(西元479)，东海郡转属冀州，改名北东海郡。东魏武定七年(公元549年)，始置海州。隋文帝开皇三年(公元583)废东海郡，隋炀帝大业三年(公元607)，海州改为东海郡。唐高祖武德四年(公元622)，海州置总管府。武德七年(公元625)，改总管府为都督府。宋太宗至道三年(公元998)，分天下为十五路，海州属淮南路。元世祖至元十五年(公元1279)，升为海州路总管府，后改为海宁府。明太祖洪武元年(公元1368)，海宁州复改名海州，属淮安府。清康熙元年(公元1662)，从江南省分出安徽省，海州属安徽省淮安府。雍正二年(公元1724)，海州升为直隶州。民国元年(1912年)，南京临时政府裁州存县，改海州直隶州为东海县，治海州城内。1952年7月，锦屏区易名为海州区，仍隶新海连市。1992年6月，经连云港市人民政府批准，成立海州经济技术开发区，为区政府派出机构。海州区自然与人文景观相得益彰。因相传孔子曾来此登山观海而得名的孔望山是国家4A级风景区，"孔望山汉代摩崖石刻"为国家一级保护文物，"锦屏山将军崖岩画"被誉为中国最早的一部天书，白虎山、石棚山、桃花涧、白鸽涧等自然景观和城内的"九庵十八庙"等历史景观"古、神、幽、奇"为一体。